Tissue Prep for NGS Assaysキットの概要
サンプル調製はどのようなアッセイにおいても重要なステップであり、CUT&RUNやCUT&Tagでは高品質な核を用いることが、結果を成功に導く鍵となります。 Tissue Prep for NGS Assaysは、そのChIC/CUT&RUNやCUT&Tag反応用として最適化された核調製試薬です。
Tissue Prep for NGS Assaysには、ChIC/CUT&RUNやCUT&Tag-IT® R-loop Assays kit用の高品質な核を調製するためのLysis Buffer、Protease Inhibitor Cocktail、Strainers、1 X Wash Bufferが24サンプル分含まれています。これらは、オリジナルのCUT&Tag-IT® Assay Kit – Tissue (Cat#53170)にも含まれています。
Tissue Prep for NGS Assaysの作業手順
プロトコールでは組織サンプルをホモジナイズする手順を紹介しています。
- Lysis bufferを加え、ホモジナイズする
- フィルターに通す
- 洗浄する
- 核をカウントし、再懸濁する
- CUT&RUN Assay kitやCUT&Tag-IT® R-loop Assay kit用の核調製が完了
Tissue Prep for NGS Assaysの特長
- 10mgの心臓、脳、肝臓、腎臓、脾臓組織から核を24回分調製することが可能
- 1回の調製で、0.5~40mgの組織量に対応
- CUT&RUN、CUT&Tag反応用に最適化した核調製試薬
Tissue Prep for NGS Assaysキットの構成品
- Tissue Lysis Buffer – NGS Assays, store at RT
- 40 µm Strainer, store at RT
- 1X Wash Buffer, store at 4°C
- Protease Inhibitor Cocktail, store at -20°C
Tissue Prep for NGS Assays Kit Data
Figure 1. Tissue Prep for NGS Assaysで調製した核のChIC/CUT&RUN Assay Kitによる評価
10mgのマウス肝組織をTissue Prep for NGS Assaysで処理し、調製した核について500,000個をYY1またはJunDをターゲットとするCUT&RUN反応に用いた(N=2) 。DNAライブラリーは、DNA Library Prep Kit for Illumina® (Cat. No.53220)およびDual Index Primers Set 1 (Cat. No.53221)を用いて調製し、NGS解析を実施した。
Figure 2. Tissue Prep for NGS Assaysで調製した核のCUT&Tag-IT® R-loop Assay Kitによる評価
10mgのマウス肝組織をTissue Prep for NGS Assaysで処理し、調製した核について500,000個をDNA-RNA hybridをターゲットとするCUT&Tag R-loop反応に用い(N=2)、NGS解析を実施した。
Tissue Prep for NGS Assays の資料
Tissue Prep for NGS Assays Manual [Japanese]
Tissue Prep for NGS Assays Manual [English]
こちらもご参照ください:
Name | Format | Cat No. | 価格 (税抜) | |
---|---|---|---|---|
Tissue Prep for NGS Assays | 24 rxns | 53185 | ¥55,500 | Buy |