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Recombinant Transposase Enzymes

最大96サンプルのATAC-Seq、CUT&Tagアッセイに対応可能なTn5 Transposase

概要

構成品

データ

資料

製品概要

Pre-indexed Assembled Tn5 Transposomes

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Name	Format	Cat No.	価格 (税抜)
pA-Tn5 Transposase	10 µg	53161	¥130,000	Buy
pA-Tn5 Transposase	100 µg	53162		Get Quote
Recombinant Tn5 Transposase protein	10 µg	81286	¥78,000	Buy
Recombinant Tn5 Transposase protein	100 µg	81284		Get Quote
Pre-indexed Assembled Tn5 Transposomes	1 x 96 rxns	53152	¥254,000	Buy
ATAC-Seq Buffer Set	1 set	53153	¥114,000	Buy
CUT&Tag-IT^® Assay Buffer Set - Cells	1 set	53169	¥132,000	Buy
CUT&Tag-IT^® Assembled pA-Tn5 Transposomes	16 rxns	53164	¥66,000	Buy
CUT&Tag-IT^® Assembled pA-Tn5 Transposomes	64 rxns	53166	¥228,000	Buy

バルクでのご注文の際は、“Get Quote”ボタンから必要事項をご記入いただくか、japantech@activemotif.comまでお問い合わせください。

リコンビナントTn5トランスポゼースおよびpA-Tn5トランスポゼースは、ATAC-Seq, CUT&Tagアッセイ、タグメンテーション、ChIPmentationなど多くのアプリケーションで活用されています。

96ウェルプレートタイプのPre-indexed Assembled Tn5 Transposomes

Tn5は、Pre-indexed Assembled Tn5 Transposomesとして96ウェルフォーマットでも提供しています。ATAC-Seqアッセイのハイスループット化に対応するため、8ウェルごとに切り離せる96ウェルプレートを用いた自由度の高いフォーマット設計になっています。各ウェルには、固有のi5およびi7インデックスを含むアダプターをロードしたトランスポソームが分注されているため、タグメンテーションの際に直接インデックスを付加します。それにより、これまで手間となっていたプライマーの分注操作や組み合わせ確認などが省略でき、多数のATAC-Seq反応を簡単に行えます。なお、ATAC-Seq Buffer Setは、Pre-indexed Assembled Tn5 Transposomesを用いた96回のATAC反応に使用する便利なバッファーセットです。

pA-Tn5 TransposaseとCUT&Tag-IT Assay Buffer Setについて

pA-Tn5は、自由にアダプターを設計してアセンブルする10µg (Cat. No. 53161) と100µg (Cat. No. 53162)の2種類のunloadタイプか、CUT&Tag-IT Assembled pA-Tn5 Transposomesのように既にアダプターがロードされ、16回分または64回分のCUT&Tag反応に対応可能なタイプのいずれかで使用することができます。 CUT&Tag-IT Assay Kit Anti-Rabbit (Cat. No. 53160) または Anti-Mouse (Cat. No. 53165) のプロトコールに従い、CUT&Tag-IT Assay Buffer Set-Cells (Cat. No. 53169) を使用することで、Assembled pA-Tn5 TranseposomesをCUT&Tag反応に使用できます。 CUT&Tag-IT Assay Buffer Set-Cellsは、16回分のCUT&Tag反応に対応しています。

Tn5の概要

Recombinant Tn5 TransposaseはロットごとにSDS-PAGEによるQCテストを実施しており、分子量が約55kDaかつ純度90%以上であることを確認しています (Fig.1) 。また、K562細胞由来のゲノムDNAに対してタグメンテーション試験 (Fig.2) を行い、Agilent TapeStationを用いて解析しています。DNAの大部分が200～400 bpで観察され、サンプルの平均強度が1000を超えることを確認しています。分析データはこちら。

Recombinant Tn5 Transposaseは、ATAC-Seq Assay Kitsの構成品(Assembled Transposomes) およびATAC-Seq 受託サービスで使用しています。

pA-Tn5の概要

Recombinant pA-Tn5 TransposaseはロットごとにSDS-PAGEによるQCテストを実施しており、分子量が約73kDaかつ純度90%以上であることを確認しています (Fig.3) 。また、K562細胞由来のゲノムDNAに対してタグメンテーション試験 (Fig.4) を行い、Agilent TapeStationを用いて解析しています。DNAの大部分が200～400 bpで観察され、サンプルの平均強度が1000を超えることを確認しています。分析データはこちら。

Recombinant pA-Tn5 Transposaseは、 CUT&Tag-IT^® Assay Kitsの構成品 (CUT&Tag-IT Assembled pA-Tn5 Transposomes) およびCUT&Tag-IT^TM 受託サービスで使用しています。

Pre-indexed Assembled Tn5 Transposomesの概要

Pre-indexed Assembled Tn5 Transposomesを用いて最大96回のATAC-Seq反応を簡単に実施できます。

Pre-indexed Assembled Tn5 Transposomesは追加の分注ステップを必要とせず、1ウェルあたり50,000～100,000個の細胞を加え、Tagmentation Master Mixとともに30分間インキュベートするだけです。

インキュベーション中のタグメンテーション反応により各組のインデックスがDNAに直接組み込まれます。各ウェルには、i5とi7インデックスプライマーがユニークな組み合わせで含まれているため、プライマーの分注操作や組み合わせ確認などの手間が省略でき、多数のATAC-Seq反応を簡単に行えます。

その後、反応を停止し、タグメンテーションでインデックスが挿入されたDNAを、SPRIビーズを用いて精製します。このように作製されたライブラリーは、すぐにIllumina® Sequencing Systemで解析可能です。Pre-indexed Assembled Tn5 Transposomesには、PCR増幅に使用するユニバーサルなプライマーが同梱されています。詳細は、プロトコルをダウンロードし、プレートマップをご覧ください。

使用例はこちら

製品内容

Pre-indexed and Assembled Tn5 Transposomes (Cat. No. 53152) includes:

Pre-indexed and Assembled Tn5 Transposomes, store at -20°C
P5 Primer (25 µM), store at -20°C
P7 Primer (25 µM), store at -20°C

ATAC-Seq Buffer Set (Cat. No. 53153) includes:

ATAC Lysis Buffer, store at RT
2X Tagmentation Buffer, store at -20°C
1% Digitonin, store at -20°C

CUT&Tag-IT^® Assay Buffer Set (Cat. No. 53169) includes:

Tagmentation Buffer, store at -20°C or 4°C
Dig-Wash Buffer, store at 4°C
Dig-300 Buffer, store at 4°C
Antibody Buffer, store at 4°C
1X Binding Buffer, store at 4°C
1X Wash Buffer, store at 4°C

製品データ